應用經濟研究所教師跨海洋經濟與應用經濟雙領域研究，努力朝向海洋經濟領域研究與指導學生論文，進行在地化、跨校、跨院系所跨領域合作研究與計畫，並藉由跨院系所授課，突顯本所的海洋經濟特色，在應用經濟領域中創造出教學與研究的藍海。

　　應用經濟研究所目前敦聘名譽教授2名、專任教授2名、副教授1名、助理教授1名及兼任教師1名。應用經濟研究所教師除在校積極從事教學及研究之外，並與國內外政府部門、研究單位、產業界及海洋或漁業企業公司進行學術與產業之交流合作，亦接受國科會、農業部及海委會等單位委託計畫，對研究與教學的內容與應用，裨益良多。